FMCK Stockholm är organiserat i flera verksamhetsgrupper.
- Motorcykelordonnans
- Frivilliggruppen ansvar för att rekrytera och utbilda motorcykelordonnanser samt trafiksoldat-MC
- Enduro
- Tävlingsgruppen ansvarar för träning och tävling i Enduro
- Klubblokal
- Förvaltningsgruppen ansvarar för vår föreningslokal Klangen med administration av garageplatserna